Методика системного анализа применяется в том случае, если у лица, принимающего решение (ЛПР), или нет необходимых сведений об определённой объективной ситуации (состоянии или процессе), позволяющих её формализовать и прийти к решению задачи, которая стоит перед ЛПР, или эти сведения недостаточны для успешного решения задачи.
В таком случае возможно представление ситуации в виде некой системы желательно с учетом всех ресурсов, задействованных в ситуации, и связей между ними. Последующее привлечение экспертов в тех областях знаний, которые реально могут помочь при описании ресурсов и взаимосвязей системы и организация мозговых атак получило название "деловые игры" и практиковалось в том числе Г. Щедровицким и его последователями.
Рекомендуется не избегать различных подходов к описанию систем для создания эффективного столкновения идей с целью получения оптимального решения данной задачи.
Методика должна помочь в достижении полноты анализа и последующем формировании модели принятия решений. Чаще всего в методике сочетаются методы из МАИС (методы активизации интуиции специалистов) и из МФПС (методы формального представления систем).
идентификация симптомов; определение актуальности проблемы; определение цели; вскрытие структуры системы и её дефектных элементов; определение структуры возможностей; нахождение альтернатив; оценка альтернатив; выбор альтернативы; составление решений; признание решения коллективом исполнителей и руководством; запуск процесса реализации решения; управление процессом реализации решения; оценка последствий реализации. Методика по Квейду
постановка задачи – включает определение проблемы, выявление целей и определение границ задачи; поиск – включает сбор сведений и определение альтернативных средств достижения целей; толкование – построение модели и её использование; реализация – агрегирование предпочтительной альтернативы или курса действий; подтверждение – экспериментальная проверка решения. Методика Янга
определение целей организации; выявление проблем организации; исследование проблем и постановка диагноза; поиск решения проблемы; оценка всех альтернатив и выбор наилучшей; согласование решений в организации; утверждение решения; подготовка к вводу; управление применением решения; проверка эффективности решения. Методика Голубкова
постановка задачи; исследование; анализ; предварительное суждение; подтверждение; окончательное суждение; реализация принятого решения. Методика Черняка
анализ проблемы; определение системы; анализ структуры системы; формирование общей цели и основного критерия; декомпозиция цели, выявление потребности в ресурсах, процессах; выявление ресурсов и процессов, композиция цели; прогноз и анализ будущих условий; оценка целей и средств; отбор варианта; диагноз существующей системы; построение комплексной программы развития; проектирование организации для достижения цели. Методики Квейда, Оптнера и Голубкова больше внимания уделяют разработке и исследованию альтернатив принятия решений. Черняк акцентирует внимание на агрегировании и структуризации целей. У Янга особое внимание уделено процессу реализации принятого решения.