pRi-плазмиды
Другой тип плазмид обнаружен у A. rhizogenes, они названы pRi-плазмидами (root inducing) и вызывают у растений разрастание корешков. При заражении растений эти плазмиды включают несколько копий Т-ДНК в состав растительного генома и способствуют синтезу опинов. Наличие Т-ДНК не оказывает вредного действия на растение-хозяин, что может оказаться причиной предпочтительного использования pRi-плазмид при конструировании трансгенных растений.
Естественный спектр растений-хозяев для Agrobacterium ограничен семейством двудольных, поэтому, несмотря на прогресс в области генной инженерии, обусловленный применением этого подхода, необходимы более универсальные методы введения чужеродной генетической информации в растительные клетки. Одним из таких методов является метод биологической баллистики.